八幡神社と八雲神社（天王様）が合祀され、て現在の姿となりました。
神社周辺は、中世の武士団である武蔵七党の一つ・横山党の本拠地であったと伝えられています。
境内にはその祖である横山（小野）義孝を祀る横山神社も鎮座しています。
江戸時代には、八日市宿より東側の宿場町と元横山村の鎮守として、多くの人々の信仰を集めました。
八雲神社の大祭は「下の祭り」と呼ばれ、山車や神輿が町を練り歩く賑やかな祭礼として親しまれてきました。
また、八王子の総鎮守である多賀神社（元本郷町）の例大祭「上の祭り」とともに、この二つの祭りが結びつき、現在の八王子まつりの基礎を形づくったとされています。